日本大学分为国公立大学和私立大学三类，日本国公立大学偏重学术研究，日本私立大学偏重社会实践，各有优势。据日本文部科学省发布，日本目前拥有国立大学86所，公立大学86所，私立大学603所，计775所大学。下面总结的是排名前100大学院校。
1、1名-10名
东京大学、京都大学、东京工业大学、大阪大学、东北大学、名古屋大学、九州大学、北海道大学、庆应义塾大学、早稻田大学
筑波大学、广岛大学、东京医科齿科大学、神户大学、横滨市立大学、千叶大学、一桥大学、长崎大学、新泻大学、大阪市立大学、熊本大学、冈山大学、金泽大学、岐阜大学、德岛大学、东京农工大学、鹿儿岛大学、大阪府立大学、东京都立大学、群马大学、横滨国立大学
3、31名-60名
山口大学、名古屋工业大学、山智大学、东京理科大学、青山学院大学、同志社大学、京都工艺纤维大学、九州工业大学、明治大学、御茶水女子大学、立命馆大学、埼玉大学、信州大学、东海大学、国际基督教大学、电器通信大学、北陆先端科学技术大学院大学、东京学艺大学、长冈技术科学大学、国际教养大学、明治大学、东京艺术大学、东京海洋大学、岩手大学、静冈大学、立命馆大学、茨城大学、中央大学、立教大学、法政大学
4、61名-100名
冲绳科学技术大学院大学、立命馆亚洲太平洋大学、奈良女子大学、会津大学、名古屋市立大学、三重大学、德岛大学、京都府立大学、山形大学、福井大学、富山大学、鹿儿岛大学、琉球大学、福岛大学、山梨大学、爱媛大学、鸟取大学、大分大学、关西大学、关西学院大学、宫崎大学、宇都宫大学、日本大学、东洋大学、秋田大学、和歌山大学、弘前大学、岛根大学、高知大学、鸟取大学、滋贺大学、学习院大学、北九州市立大学、小樽商科大学、近畿大学、南山大学、专修大学、东海大学、芝浦工业大学、丰田工业大学
